MAS的发病机制亦不完全清楚,其发生是多种因素作用的结果。细胞因子风暴在 MAS 的发生中起重要作用,MAS 患者IL-1、IL=6、IL-18、TNF-a和IFN-γ均明显升高。sJIA(幼年特发性关节炎)患者IL-6表达明显升高;sJIA合并MAS时IL-18明显升高;SLE(红斑狼疮)合并MAS,TNF-a表达明显升高。sJIA中异常的各种细胞因子对于MAS的发生起重要作用。类似于原发性HLH,早在2003年就有学者报道sJIA合并MAS的患者NK细胞的细胞毒功能缺陷,部分患者同时伴有NK或T细胞的穿孔素水平表达下。这一结果在高表达IL-6的转基因小鼠也被发现,将人类外周血单个核细胞加人IL-6孵育也提示高表达的IL-6可以通过抑制穿孔素和颗粒酶的表达从而降低NK细胞的细胞毒活性。IL-18明显升高也是sJIA患者合并MAS的一个易感因素。
感染是MAS发生的一个重要诱发因素。MAS通常发生在一个高炎症因子的背景下,比如sJIA起病时或疾病活动期,在sJIA的基础上合并感染可诱发 MAS 的发生。在转基因小鼠模型中造成高 IL-6 表达的炎症因子背景、急性感染成功地诱发了MAS的发生。2014年的一项研究表明,1/3的sJIA患者MAs的发生是由感染诱发的。