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本来想正月十五晚上发出来的，结果昨天晚上，在微信上和别人吵了一架，这也算是一个本事吧。给耽误了。下面接着吹，这是最后一篇了。
绿框里的2、其他隐形遗传杂合或与个人临床吴明确关联的基因变异，这个属于基因报告的第四大部分的第2小部分。
我们来看一下，顺便来给大家填2个前面挖的坑。
该表前两行，是同一个基因的变异情况。基因名字叫SLC26A4，分别有两点的碱基突变。来自母亲的是chr7-107334870这个点，来自父亲的是chr-7107342477这个点。这种来自于父母染色体的不同点位的突变情况，叫复合杂合突变。
如果来自于父母的两个染色体同一个点位的突变，叫纯合突变。比如，来自于母亲的染色体chr7-107334870这个点，和来自于父亲的同一个点chr7-107334870也有突变，这个叫纯合突变。
无论是复合杂合突变还是纯合突变，只要不是同义突变，一般都有致病的可能性。
那么杂合突变是什么情况？看第3 、4 、5行，这几个基因的突变分别来自母亲、父亲、母亲，说明对应父亲、母亲、父亲的该染色体没有突变，这种一边变化，另一边是好的组合情况，是杂合突变。
染色体位置chr-7107334870后边有个【1】，第2行还有个【2】，这说明该基因可能在某些文献中报告过，一会结合文献再给大家说一下。
还记的我们说个几个碱基翻译一个氨基酸吗？是不是3个碱基翻译一个氨基酸。看看上边的例子，碱基是1286的位置，氨基酸是429的位置。是不是429*3=1287，发生位置是1286，说明是三个碱基中的第2个碱基发生了问题。其他的突变基本是这个规律，即P后边的数字乘以3等于C后边数字±3。
下面填另一个大坑。这个坑填起来有点难理解。在接着往下看这个图。
c.2226_2232 DelAACTTAT （p.T743Ifs*16）这段表示中分别又出现了3个代码。做一下数学题，743*3=2229 和2226差3个数。
Del，和我们电脑中的Del是一个意思，表示删除，可以理解为碱基缺失。在2226-2232这7个点位，缺失了AACTTAT这7个碱基。
造成了什么后果呢？
p.T743Ifs*16 结果就是这第743个氨基酸由T变为了I。
fs是什么意思呢？fs的意思是读码框偏移的意思。为什么会发生读码框框偏移呢？还是因为3个碱基对应一个氨基酸。因为缺了7个碱基，7不是3的倍数，所以，读码时就发生偏移。Fs就是读码框偏移的意思。
“*” 又是什么意思？ 这里的“*”的意思是表示氨基酸翻译终止。是遇到了三个终止密码子的其中一个。因为少了7个氨基酸，所以，发生了读码框偏移，造成了提前遇到了密码子，导致了了氨基酸翻译终止。有的报告里，不是用“*”表示的，使用“Ter”或者“X”表示的。
如本例可以写成p.T743IfsTer16或p.T743IfsX16
16的意思是 从上边743个氨基酸开始，往后翻译了16个氨基酸后，遇到终止密码子后，停止翻译了。
除了有删除Del，还有插入Ins，重复dup等。具体见下面的解释。
“>”表示碱基替换，如c.76A>T。
“_”表示从起始位置编号到终止位置编号范围的受到影响，如c.76_78del。
“del”表示缺失，如c.76delA。
“dup”表示重复，如c.8dupG
“ins”表示插入，如c.76_77insG。
“delins”表示同时有缺失和插入，如c.112_117delinsTG。
“inv”表示倒位，如c.76_83inv。
“con”表示转换，如c.123_678conNM_004006.1:c.123_678。
“()”表示发生变异的具体位置不确定，如c.(67_70)insG。
“[]”表示发生在某个等位基因上，如c.[76A>T]；或者已确定的数量，如c.123_124[4]。
这是最基本的一些变化，还有一些复杂的变化，在报告中很少遇到。如果遇到，可以打报告公司的电话询问。
以上都是DNA有关的突变，所以开头都是“c.“。这些造成的后果就是氨基酸的改变和无非就氨基酸的提前推后编码结束。
接着看第5部分，如下图。
这是上一张图中，列出的那两个【】中所列出的文献。
有人可能会说，哎呀，这个点突变发生过相关报道，会不是我们的也有问题。关于文献我想说一下，一般后边都会有一个PMID编号。如第一个文献中的PMID：21961810。
PMID是什么呢？
是PubMed搜索引擎中收录的生命科学和医学等领域的文献编号。在下面这个网站上可以找到。一般是英文的文献。如果看不懂，还可以到丁香园网站去求助，求助方法在另一个链接中。
是不是文献报道出来，就一定会致病呢？
我想是不一定的。
因为大部分文献中可能提到过这个点位突变，但是情况不一定是我们本人一样。有的可能是这个基因和其它疾病相关，有的可能除了这个基因外，还有其它基因突变或其他因素在里面。这个判定，还真的是要结合杂合纯合、携带率、蛋白预测、以及病人疾病表型和家族发病情况综合判断，而不是单单某个点来判断。
同理，在表格的第10行中，写明了这个基因和噬血相关，是不是就大事不妙了？担心是可以理解的，但是也要分情况来判断。结合上一段话和我补录的一段话来理解吧。不一定对，可以参考一下。
比如我家娃娃情况，也有这么一篇报道写到UNC13D这个基因，还是和噬血相关的基因哦，有过文献报告发生突变导致噬血。我费劲巴拉的找到这个文献，才发现虽然报道中孩子因为这个突变发生噬血，但是还有其它综合因素在里面。和我们家孩子情况根本就不搭边。
报告的第七八九等部分，一般都是些名词解释或者联系方式或者基因列表什么的，没有什么多说的。
最后附几张碱基突变和氨基酸突变的图，供大家理解。
在附一张其他检查机构的报告单，供参考。这张报告单里，看一下最后两句话。是关于突变发生位置和遗传的关系。
最后，终于写完了，希望能够对大家有些帮助。
还是那句话，致病救人找专业的医生。我只负责一本正经的吹牛。
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发表于 2019-2-20 13:06
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